批发农产品没有进项发票怎么扣税?没有进项发票那是不能扣税的，正常途径只能取得专票才行，那么公司收购农产品要想索取进项票来抵扣税款，只有两种方法。
方法1：叫批发方(售货方)为你开票。首先还得看批发方是什么情况，卖的是不是免税农产品?是一般纳税人还是小规模纳税人?是中间商还是农业生产者?各自处理的情况都不同的：一般纳税人销售自产农产品免增值税，购买方是一般纳税人时，将现行开具免税普通发票改为开具专用发票，发票上税率为13%(实际免税);小规模纳税人销售自产农产品免增值税，购买方是一般纳税人时，将现行开具免税普通发票改为向税务机关申请代开专用发票。
发票上税率为13%(实际免税);农户销售自产农产品，购买方是一般纳税人时，为防止虚开冲动，停止由购买方开具收购发票，改为农户向税务机关申请代开专用发票，发票上税率为13%(实际免税);小规模纳税人批发、零售农产品，未享受免征增值税政策的，征收率为3%，购买方是一般纳税人时，将现行开具普通发票改为向税务部门申请代开专用发票，发票上税率为13%(实际征收3%)。
需要注意的是：农产品过去可抵扣税率是13%，现在调整为11%了。
方法2：自己去税局申请领取农产品收购发票来自开自抵。一般来说，销售方免增值税，购买方不得抵扣，因此不得开具专用发票。但是为了扶持农业生产，农业生产者销售自产农产品免增值税，购买方为一般纳税人可以抵扣，这种交易类型可以开具农产品收购(销售)发票，此发票不是专票，但是有抵扣功能。
因为根据《财政部 **税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》(财税〔2017〕37号)**条规定：
(一)除本条第(二)项规定外，纳税人购进农产品，取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额;从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和11%的扣除率计算进项税额;取得(开具)农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算进项税额。
但是需要注意的是，只有向农业生产者购进其自产自销农产品才能比照以上情况处理，通俗点说就是从农民手中批发购买他本人自己种植的农产品才能开收购发票来抵扣。否则一旦被税务机关检查到会认定你存在虚开虚抵行为，除了被责令作进项税转出、补税外，还会面临罚款!
严重的会被列入税务稽查，稽查局一旦认定你为虚开，定性为偷税，罚款较高为税款的5倍!如果你不交，就会进入政府联合惩治失信系统，较直接的影响是贷不了款，飞机高铁坐不了，出不了国了。所以较好还是别打违法的主意，踏踏实实经营。
关于农产品的范围，详见《财政部、**税务总局关于印发<农业产品征税范围注释>的通知》(财税字〔1995〕52号)，包括种植业、养殖业、林业、木业、水产业生茶的各种植物、动物初级产品和经过简单加工的农产品。
不得不说，**对农业、对农民的政策扶持力度是相当大的，除了免征公粮农业税外，农民自产自销的农产品也是免税的。
